Bibliotecas GBS | RADseq | ddRADseq | NextRAD
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Construímos bibliotecas para identificação e genotipagem simultânea SNPs. A redução da complexidade genômica se dá por meio da ação de enzimas de restrição, com posterior inserção de sequências barcodes para identificação individual e de sequências complementares aos adaptadores da plataforma illumina.
O sequenciamento é realizado em sequenciador HiSeq 2500 illumina (illumina) e pode ser executado de duas formas:
- No modo high throughput, onde uma lane gera em torno de 250 milhões de reads. O número de reads por amostra depende do número total de amostras sequenciadas na lane;
- No modo Rapid Run, onde uma flowcell gera em torno de 300-320 milhões de reads. O número de reads por amostra depende do número total de amostras sequenciadas na flowcell.
Os resultados gerados a partir do sequenciamento são entregues na forma de arquivos digitais no formato FASTQ em um prazo de 60 a 90 dias após o recebimento das amostras pela empresa.